基于分子对接技术虚拟筛选延胡索抗心肌缺血

摘要:目的研究延胡索抗心肌缺血的物质基础及作用机制。方法通过TCMSP平台筛选到符合条件的目标小分子化合物,运用Maesrto11.1分子对接软件筛选延胡索中与相应靶点蛋白对接较好的小分子化合物,再运用Cytoscape3.6.1构建多成分-靶点网络药理图,通过拓扑学分析,阐释其网络特征。结果在16种心肌缺血靶点对接结果中,8种季铵碱化合物、1种黄酮类、2种叔胺碱类显示出了较好的对接结果。季铵碱类化合物和黄酮类槲皮素对接结果普遍优于叔胺碱类,对接结果中季铵碱打分平均值高于叔胺碱的靶点蛋白有10种。网络药理学结果分析得知多化合物-靶点的网络异质性为0.57,平均相邻节点数3.59,特征网络长度3.02,网络中心度0.21。结论延胡索季铵碱类化合物黄连碱、巴马汀、去氢紫堇鳞茎碱、药根碱、非洲防己碱、小檗碱,黄酮类槲皮素可能是其治疗心肌缺血的物质基础,延胡索治疗心肌缺血是多成分与多靶点相互作用的结果。

延胡索为罂粟科植物延胡索CorydalisyanhusuoW.T.Wang的干燥块茎。其味辛、苦,性温,归肝、脾经,具有活血、利气、止痛之功效,用于治疗胸胁、脘腹疼痛等疾病[1]。延胡索中主要化学成分为生物碱类,包括叔胺碱和季铵碱,其中叔胺碱类研究较多,叔胺碱类物质主要起镇痛作用,季铵碱类物质研究报道较少,延胡索季铵碱可以起到抗心肌缺血的作用[2-3],但其具体的作用机制鲜有报道。分子对接方法(moleculardockingmethod)是通过化学计量学方法模拟分子的几何结构和分子间作用力来进行分子间相互作用识别并预测受体-配体复合物结构的方法,分子对接技术是一种重要的计算机辅助药物分子设计手段,对于中药药效物质基础的高效、快速筛选,药效作用机制研究有重要意义[4-5]。本研究运用分子对接技术研究延胡索作用于心肌缺血的活性分子的作用机制,并构建多成分-靶点蛋白网路模型,筛选延胡索抗心肌缺血物质基础,阐明中药具备多成分、多靶点的作用特点,为进一步探讨延胡索对心肌缺血疾病的治疗提供参考。

1材料与方法

1.1TCMSP平台

UniProt数据库(


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